Предприниматель утрачивает право на применение патентной системы налогообложения в трех случаях (п. 6 ст. 346.45 НК РФ):

Во-первых, в случае неуплаты налога в установленные сроки.

Во-вторых, при превышении порога средней численности (15 человек) наемных работников в течение налогового периода.

В-третьих, когда доходы по всем видам «патентной» деятельности с начала календарного года превысили 60 млн. рублей. Сумма полученного дохода от реализации определяется в соответствии со ст. 249 НК РФ нарастающим итогом с начала календарного года. Если предприниматель одновременно применяет патентную систему налогообложения и УСН, то ему необходимо учитывать доходы по обоим спецрежимам. Утрата права на применение патентной системы налогообложения носит заявительный характер: в течение 10 календарных дней со дня, когда было нарушено ограничение по доходам от реализации или по величине средней численности работников, либо своевременно не был перечислен патентный налог, индивидуальный предприниматель должен представить в налоговые органы соответствующее заявление об утрате права (п. 8 ст. 346.45 НК РФ). По поводу системы налогообложения, по которой надо облагать «патентную» деятельность после потери права применять по ней ПСН, существуют разногласия.  Согласно требованиям пункта 6 статьи 346.45 НК, налогоплательщик считается утратившим право на применение патентной системы налогообложения и перешедшим на общий режим налогообложения. Однако если налогоплательщик применяет УСН, то возникает нестыковка между главами НК, ведь согласно главе 26.2, применение упрощенной системы налогообложения предусматривает освобождение от уплаты налогов ОСНО (НДФЛ и НДС), не делая никаких исключений для ситуации потери права применения ПСН. В отличии от ПСН, под которую попадают только определенные виды деятельности налогоплательщика, УСН облагаются все виды деятельности.  На это в свое время указал еще Конституционный суд в своем определении от 16 октября 2007 г. N 667-О-О.

Информация может быть не полной и/или не актуальной в связи с изменением законодательства